2020年9月17日，经“中关村全球高端智库联盟首届理事长会议”第一次工作会议投票表决，北京市科学技术研究院当选为首届联盟理事长单位。根据联盟章程，时任北京市科学技术研究院院长郑焕敏为联盟第一届理事长。
2021年11月，因领导干部调整，伍建民同志担任北京市科学技术研究院院长。根据联盟章程，中关村全球高端智库联盟第一届联盟理事长由郑焕敏同志变更为伍建民同志。
理事长单位：
北京市科学技术研究院
副理事长单位：
北京市社会科学院
北京大学首都发展研究院
国家能源集团技术经济研究院
贵州省社会科学院
华南理工大学公共政策研究院
吉林大学中国国有经济研究中心
盘古智库
千龙智库
清华大学科技发展与治理研究中心
全球化智库
上海社会科学院
新华网思客
中国电子信息产业发展研究院
中国（海南）改革发展研究院
中国（深圳）综合开发研究院
中国互联网新闻中心
中国科协创新战略研究院
中国科学技术发展战略研究院
中国科学技术交流中心
中国科学院科技战略咨询研究院
中山大学粤港澳发展研究院
中央党校（国家行政学院）科研部
美国环保协会EDF
日本公益财团法人环日本海经济研究所
塞尔维亚克拉古耶瓦茨大学
施普林格·自然集团
新加坡金融科技协会
以色列耶达技术转移公司
理事单位：
安徽省安策智库咨询有限公司
百年红智库
北京方迪经济发展研究院
北京生态文明工程研究院
北京市盈科律师事务所
北京体育大学冬奥研究中心
北京五洲融合创新产业战略研究院
北京中关村科技产业研究院有限公司
北京中医药大学国家中医药发展与战略研究院
重庆金融科技研究院
广东亚太创新经济研究院
国发智库研究院
国观智库
河北工业大学京津冀发展研究中心
河北省科学院
华城智库科学研究院
黑龙江省科学院
华略智库
经士国际咨询服务（海南）有限责任公司
科大讯飞股份有限公司
青海省社会科学院
全球技术创新联盟合作伙伴有限公司
山东伏羲智库互联网研究院
沈阳产业技术研究院
首都科技发展战略研究院
赛尔维亚科学促进中心
双绿智库
随锐科技集团股份有限公司
沈阳产业技术研究院
万博新经济研究院
振兴国际智库
中国国际科技促进会医工结合分会
中国科学院文献情报中心
中国农业国际合作促进会
中国西部研究与发展促进会
中国信息安全研究院有限公司
法国国家工业环境与风险研究院
韩国生产技术研究院青岛代表处
韩中科学技术合作中心
能源与交通创新中心
欧洲综合风险管理学会
新亚洲战略研究中心
以色列希伯来大学在线创新中心
印度科学与工业研究理事会—国家科学传播与政策研究所
联盟理事长：伍建民
伍建民，北京市科学技术研究院党组副书记、院长，经济学博士，研究员。中国人民大学本科、硕士毕业，中国社会科学院研究生院博士毕业。历任北京软件和信息服务业促进中心副主任，北京市可持续发展科技促进中心主任，北京市科学技术委员会科技宣传与软科学处处长，北京市科学技术委员会党组成员、副主任，北京怀柔科学城党工委委员、管委会副主任，长期从事科技创新发展的战略、规划、改革、政策、项目、工程等方面的研究协调、组织管理、实施推进工作。
李军凯，北京市科学技术研究院国际与区域合作中心主任、中关村全球高端智库联盟秘书长、“一带一路”国际科技合作培训中心主任，管理学博士，教授、博士生导师。中国人民大学本科、硕士毕业，北京大学博士毕业。曾任河北大学副校长（挂职）、北京大学工学院党委副书记、北京大学就业中心副主任、北京大学图书馆（教育部中国高校人文社会科学文献中心全国管理中心)副秘书长，长期从事科技创新、区域经济、就业创业等领域的科研与管理工作，主持国家和省部级研究课题30余项，发表论文70余篇，出版专著、书籍19部。近年来，完成内参、研究报告30余篇，获得中央领导及省部级领导批示20余次。
联盟秘书处设于北京市科学技术研究院