8月2日，西北大学生命科学学院教授孙士生课题组与西安电子科技大学教授张军英课题组联合团队的研究成果在线发表在《自然—方法》上。该成果介绍了一种可解析糖蛋白上糖链序列的新方法及配套软件——StrucGP，并描述了其技术细节。
据了解，糖类和蛋白质作为四大生物大分子之一，在生命活动中发挥非常重要的作用。其中N—连接糖蛋白主要存在于细胞膜表面和各种体液中，参与细胞间识别和通信、免疫应答、病原体的宿主识别等重要生物学过程。很多糖蛋白已经成为重要的疾病生物标志物和药物靶标。但由于糖链结构的复杂性和糖基化不均一性特性，糖基化位点特异性的糖链序列测定（也称糖链结构解析）依然存在极大挑战。
在孙士生团队建立的新方法中，StrucGP采用了模块化的解析策略，首先将N—连接糖链结构分为核心结构、糖链类型以及分支结构3个部分，分别进行从头结构解析，然后合并获得糖链的整体结构信息，极大地降低了糖链结构解析的复杂度，提高了糖链结构解析的准确性。研究团队还建立了基于诱饵数据库和诱饵谱图的假阳性率评估方法，以及多种对糖链各模块精细结构的置信度评估方法，有助于研究人员对鉴定结构进行可信度评估。
该技术首次实现了完整糖肽上N—连接糖链序列的解析，为糖蛋白质组学研究提供了新的技术手段，在新生物标志物和治疗靶点的发现、重要糖蛋白抗体药物的糖基化分析、病毒上重要糖蛋白的糖基化解析、疾病致病机理研究等方面都具有广泛的应用前景。